In anul universitar 1992/1993 îşi începe activitatea specializarea Agricultură, înfiinţată ca urmare a iniţiativei unui grup de cercetători de la staţiunile de cercetări agricole din Dobrogea şi din cadrul Direcţiei Agricole Judeţene dintre care se remarcă dr.ing. Mihail Enciu. Din 1995, specializarea funcţionează pentru o perioadă de doi ani ca secţie a Universităţii de Stiinţe Agricole şi Medicină Veterinară din Bucureşti, seriile respective de studenţi susţinând examenul de admitere la Bucureşti. Ulterior, după parcurgerea procesului acreditării, specializarea revine în cadrul Universităţii Ovidius.

In anul universitar 1999/2000 ca urmare a cererii de cadre didactice specializate (un mare număr de posturi de profesori de geografie din judeţ fiind ocupate de cadre didactice fără pregătire de specialitate) şi a iniţiativei conf. dr. Ion Florin Mihăilescu, se ia hotărârea înfiinţării specializării Geografie, specializare care vine să întregească în mod firesc structura Universităţii Ovidius. Concursul de admitere – prin concurs de dosare - arată de la bun început că specializarea este căutată numărul de candidaţi pe loc fiind de peste 5.

In anul universitar 2001/2002 îdemareaza cursurile şi specializarea Horticultură. Specializarea este infiintata ca urmare a iniţiativei unui grup de specialisti in agricultura care sesizeaza oportunitatea creerii unei astfel de specializari, cerute atat de absolventii de licee de specialitate cat si de persoane care dezvolta afaceri in domeniu dar nu au studii de specialitate. Cursurile incep in primul an doar cu studenti la forma de invatamant cu taxa, pentru ca ulterior specializarii sa-i fie afectate si locuri subventionate de la bugetul de stat.

Incepând cu anul 1999, se organizează concurs de admitere la forma de învăţământ la distanţă (IDD), la început doar la specializarea Educaţie Fizică şi ulterior, din 2000 şi la specializările Geografie şi Agricultură. Formă de învăţământ care se adresează în special acelor candidaţi care ocupă locuri de muncă pe care nu vor să le piardă, aceasta reeditează într-un mod destul de asemănător sistemul de învăţământ superior fără frecvenţă, desfiinţat în final ca ineficient.